Omicron（奥密克戎）简史

　　2021年11月24日，南非首次从2021年11月9日采集的患者样本中发现SARSCoV2变异体B。1。1。529（Omicron），并于同年11月26日被世界卫生组织（WHO）认定为令人担忧的新变异体。这一变异株被发现具有比以往任何一种病毒更高的突变数量。SARSCoV2一直在通过突变改变其遗传密码。这些突变主要发生在病毒的刺突蛋白上，导致被称为变异体的病毒的轻微修改拷贝，并使该病毒株具有独特的特性，如传染性和疾病严重程度的改变，从而导致新的感染传播率、发病率和死亡率。这种新的Omicron变异株非常令人担忧，因为它有几十种变异，可以影响其行为方式。
　　突变采用字母和数字命名，如D614G，表示病毒刺突蛋白3第614位的氨基酸从D（天冬氨酸）变为G（甘氨酸）。WHO已确定5种变异毒株，即Alpha、Beta、Gamma、Delta和最新的一种Omicron变种。除此之外，目前还正在监测着2个被命名的VOIs（感兴趣的变异株）和7个VOM（正在监测的变异体）的致病性。
　　SARSCoV2的B。1。1。529或Omicron变异体包括五个谱系，即BA。1，BA。2，BA。3、BA。4和BA（表1）。目前，WHO根据四个标准决定Omicron对人群的威胁程度：病毒传播性；既往感染和疫苗对传播、感染、疾病严重程度和死亡率的保护程度；与其他变异体相比，该变异体的毒性如何；以及人们如何遵循低公共卫生和社会措施来应对病毒的出现。根据现有证据，SARSCoV2的Omicron变种具有更高的传染性，在社区中传播更快，比新冠肺炎大流行中先前确定的其他变种发病率更高。截至2022年6月20日，英国和美国报告了近120万例Omicron或B。1。1。529变体感染病例。在过去的半年时间里，B。1。1。529的几个已确定的亚株已在全球迅速蔓延（表1，2）。尽管感染B。1。1。529变异株或Omicron变异株的严重疾病和死亡风险比以前的SARSCoV2变异株低，但极高的传播水平导致住院人数显著增加，全球医疗系统面临巨大需求。
　　表1。SARSCoV2的B。1。1。529或Omicron变异体五个（Pango）谱系包括BA。1、BA。2、BA。3、BA。4和BA。5
　　Omicron谱系
　　首次检测的地理区域
　　首次检测日期
　　被命名日期
　　WHO状态
　　B。1。1。529
　　南非
　　2021。11。242021。11。26
　　被命名为VOC
　　VOC
　　BA。1
　　南非
　　2022。1
　　2022。2。22再次被命名为VOC
　　VOC
　　BA。2
　　南非
　　2022。1
　　2022。2。22再次被命名为VOC
　　VOC
　　BA。3
　　南非
　　2022。1
　　未命名全球范围内被检测到，但病例很少
　　未命名
　　BA。4
　　南非
　　2022。1
　　2022。6。7被命名为VOCLUM
　　VOCLUM
　　BA。5
　　南非
　　2022。1
　　2022。6。7被命名为VOCLUM
　　VOCLUM
　　WHO建议，公共卫生当局应将这些B。1。1。529子代谱系作为不同谱系进行监测，并对其病毒特征进行比较评估。VOC，变异毒株；VOCLUM监测中的变异毒株。摘自WHO，SARSCoV2变异体，2022年6月7日。
　　表2。截至2022年6月7日，纳入WHO监测的变异毒株谱系（VOCLUM）的Omicron谱系
　　Pango株命名法
　　与OmicroVOC的关系
　　首次检到的地理区域和日期
　　BA。4
　　BA。1和BA。2的姐妹株
　　南非，2022。1
　　BA。5
　　BA。1和BA。2的姐妹株
　　南非，2022。1
　　BA。2。12。1
　　BA。2的亚株
　　美国，2021。12
　　BA。2。9。1
　　BA。2的亚株
　　多国，2022。2
　　BA。2。11
　　BA。2的亚株
　　多国，2022。3
　　BA。2。13
　　BA。2的亚株
　　多国，2022。2
　　2022年5月12日，欧洲疾病预防和控制中心（ECDC）从感兴趣变异体（VOI）到变异毒株（VOC）重新分类BA。4和BA。5亚株。摘自WHO，SARSCoV2变异体，2022年6月7日。
　　截至2022年6月20日，英国和美国报告了近120万例Omicron或B。1。1。529变体感染病例。在过去的六个月里，B。1。1。529的几个已确认的亚株在全球迅速蔓延。最初确定的谱系包括BA。1和BA。2。然而，BA。4、BA。5和亚株BA2。12。1现在在欧洲和美国占优势。2022年5月12日，欧洲疾病预防控制中心（ECDC）将BA。4和BA。5从感兴趣的变异体（VOI）重新分类为变异毒株（VOC）。人们越来越担心，以前感染SARSCoV2和使用这些变异体出现之前开发的疫苗接种可能无效。
　　最近的人口和实验室研究支持对新的SARSCoV2变异体Omicron谱系和亚株的潜在威胁的担忧。2022年6月17日，《自然》杂志报道了BA。2。12。1，BA。4和BA。5表现出比BA。2更高的传播力。刺突（S）蛋白的结构比较显示BA2。12。1和BA。4BA。5具有与BA。2相当的血管紧张素转换酶2（ACE2）结合亲和力。此外，BA。2。12。1，BA。4和BA。5与BA。2相比，当针对三倍疫苗接种患者和BA。1感染患者的血浆进行测试时中和逃逸增加。对中和抗体的表位分布和Omicron中和效力的研究表明，Omicron可能会进化出突变，以逃避BA。1感染后的体液免疫反应。因此，BA。1衍生的疫苗加强剂可能无法获得足够的免疫保护新的Omicron谱系。实验室研究表明，接种疫苗后产生的抗体在阻断BA。4和BA。5病毒的效果不及早期的Omicron变异体，包括BA。1和BA。2，可能是由于BA。4和BA。5中的L452R和F486V棘突突变。
　　因此，由于Omicron之VOCs的全球传播越来越快，随后预计病毒多样性也会增加。WHO于2022年6月7日在其SARSCoV2变种追踪系统中增加了一个新类别。VOCLUM倡议旨在向全球公共卫生当局通报可能需要优先关注和监测的VOC谱系（表2）。VOCLUM的主要目标是调查这些谱系是否对全球公共健康构成额外威胁。如果任何谱系显示出与原始VOC相比可能增加疾病发病率或严重程度的独特特征，TAGVE和WHO可将该病毒确定为VOCLUM。
　　SARSCoV2的B。1。1。529或Omicron变异体目前是全球流行的主要变体。Omicron的一些亚株与其他循环VOC谱系和突变变化相比显示出传播优势，这赋予了传播或感染优势。例如，包括英国在内的一些国家已经让公共卫生当局意识到Omicron的BA。2可能具有传播优势，这解释了其日益流行的原因，包括居家医疗。
　　WHO的VOCLUM倡议的主要作用包括：审查全球病毒流行病学；跟踪全球传播；通过WHO生物中心共享病毒分离物；将完整的基因组序列提交到公开可用的数据库；提高VOCLUM对新冠肺炎流行病学潜在影响的认识；以及VOCLUM对相关病毒特征影响的实验室评估。
　　结论
　　WHO制定了新的VOCLUM倡议，以重新认识Omicron（或B。1。1。529，SARSCoV2变种）新谱系和亚株的重要性。由于突变率高，Omicrons（或B。1。1529，SARSCoV1变种）的新谱系或亚株的出现可能会继续下去。令人担忧的是，随着人群中SARSCoV2检测的减少，由于缺乏病毒基因组数据，新兴病毒的流行病学前景可能变得不明朗。
　　参考文献：
　　〔1〕MenniC，etal。Symptomprevalence，duration，andriskofhospitaladmissionininpidualsinfectedwithSARSCoV2duringperiodsofomicronanddeltavariantdominance：aprospectiveobservationalstudyfromtheZOECOVIDStudy。Lancet，2022；339：161824。
　　〔2〕ParumsDV。Editorial：WorldHealthOrganization（WHO）VariantsofConcernLineagesUnderMonitoring（VOCLUM）inResponsetotheGlobalSpreadofLineagesandSublineagesofOmicron，orB。1。1。529，SARSCoV2。MedSciMonit，2022；28：e937676。